Rsync — найкраща у світі штука для бекапів. Отак робиться бекап каталогу /home/noddeat/mysuperfiles на зйомний диск, замонтований в /media/backup-disk:
rsync -avx /home/noddeat/mysuperfiles/ /media/backup-disk/backup-directory-for-superfiles/
За посиланням вище — більше корисних прикладів.